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1.样品处理(样本处理区)
1.1样本前处理
取待检样品组织,加入 4 倍体积的 TE,匀浆化;将匀浆化的组织反复冻融 3 次,3000 r/min离心 30 min,取上清液。其他样品前处理可参考 SNT4053-2014。
1.2核酸提取
推荐采用公司生产的核酸提取或纯化试剂(磁珠法或离心柱法)进行核酸提取,请按照试剂说明书进行操作。
2.试剂配制(试剂准备区)
根据待检测样本总数,设所需要的 PCR 反应管管数为 N(N=样本数+1 管阴性对照+1 管阳性对照;样品每满10 份,多配制 1 份),每测试反应体系配制如下表:
试剂 反应液酶液
用量(样本数为 N)19μL1μL
将混合好的测试反应液分装到 PCR 反应管中,20μL /管。
3.加样(样本处理区)
将步骤 1 提取的核酸、阳性质控品、阴性质控品各取 5μL,分别加入相应的反应管中,盖好管盖,混匀, 短暂离心。
4.PCR 扩增(核酸扩增区)
4.1将待检测反应管置于荧光定量 PCR 仪反应槽内;
4.2设置好通道、样品信息,反应体系设置为 25μL;荧光通道选择: 检测通道(Reporter Dye)FAM, 淬灭通道(Quencher Dye)NONE,请勿选择ROX 参比荧光,选择 None 即可。
4.3推荐循环参数设置:
步骤循环数温度时间收集荧光信号
11 cycle95℃2min否
245 cycles95℃15sec否
60℃30sec是
5.结果分析判定
5.1结果分析条件设定(请参照各仪器使用说明书进行设置,以分析 ABI7500 仪器为例)
反应结束后自动保存结果,根据分析后图像调节 Baseline 的 Start 值、End 值以及 Threshold 值(用户可根据实际情况自行调整,Start 值可以在 3~15、End 值可设在 5~20,使阈值线位于扩增曲线指数器,阴性质控品的扩增曲线平直或低于阈值线),点击 Analyze 自动获得分析结果。
5.2结果判断
阳性:检测通道 Ct 值≤40,且曲线有明显的指数增长曲线; 阴性:样本检测结果 Ct 值>40 或无 Ct 值。
5.3质控标准
阴性质控品:无特异性扩增曲线或无 Ct 值显示;
阳性质控品:扩增曲线有明显指数增长期,且Ct 值≤32; 以上条件应同时满足,否则实验视为无效。