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品牌 | 烜雅生物 | 货号 | XY-D-1731 |
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规格 | 10次 | 供货周期 | 现货 |
主要用途 | 科研 | 应用领域 | 化工,生物产业 |
英文名称 | DNA Shuffling Kit | 保存条件 | -20℃ |
有效期 | 1年 |
产品简介:
DNA Shuffling 即 DNA 分子的体外同源重组,它是一种分子水平上的定向进化(directed evolution)技术。DNA Shuffling 以一个或多个基因为起始材料,通过先随机将这些基因断裂成 DNA 短片段,再进行互为模板和引物的 PCR(无外加引物),最后再进行常规 PCR(外加引物)等处理,最后得到含有大量 DNA 重组突变的 PCR 产物。
产品特点:
1.即开即用,用户只需要提供样品 DNA 模板,无需单独准备各成分。
2.可以用于对长度在 1000 bp 左右的同源片段进行 DNA shuffling。
3.操作手册经过优化,只产生 DNA Shuffling,而将点突变的几率减低到最-低,节省大量优化时间。
4.本产品足够 10 次 DNA Shuffling 反应。
5.DNA Shuffling 试剂盒只适用于科研,不能用于临床。
产品参数:
成分规格包装
DNase I 溶液(1U/μL)10 μL0.5 mL 红盖管
DNA Shuffling 专用反应液 A,10×100 μL0.5 mL 绿盖管
DNA Shuffling 专用反应液 B,10×100 μL0.5 mL 紫盖管
2×DNA Shuffling 专用无引物 PCR
MasterMix1 mL1.5 mL 白盖管
2×DNA Shuffling 专用带引物 PCR
MasterMix1 mL1.5 mL 黄色管
超纯水1 mL1.5 mL 蓝盖管
使用手册1 份无
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限一年。
自备试剂
待突变基因片段、DNA Shuffling 引物(第二轮PCR 引物)、胶回收试剂盒。
使用方法:
1.提前开启 37℃和 90℃水浴或金属浴。一:待突变基因片段的制备
2.待突变基因片段可以用来源于多个物种的、含同源基因片段的 DNA。这些基
因片段可以来于PCR 制备,也可以来于限制性内切酶酶切法制备。
3.这些含同源基因片段(或同源基因片段的一部分)的DNA 片段总长度不要超过 1 kb,同时比 DNA shuffling 终产物(第二轮 PCR 产物)长 200-400 bp,因为第二轮 PCR 的引物位置在此步制备的模板 DNA 内侧 100-200 bp。
4.每次 DNA Shuffling 实验需要 2-5 μg 起始 DNA 片段。如果使用几个同源基因片段,则其比例为 1:1:1,总量保证有 2-5 μg。
5.起始模板 DNA 必须通过胶回收纯化,以便彻-底去除残留的质粒模板、引物和非特异扩增产物等。如果不去除此步的引物,其将对后续 PCR 造成严重干扰。
6.测 OD260 确定模板 DNA 浓度,此溶液为同源基因 DNA 模板,放冰上待用。二:酶切和回收模板 DNA
7.准备 10 μL DNase I 工作液(0.1 U/μL)。将 1 μL 本试剂盒提供的 1 U/μ
L 的 DNase I 溶液和 8 μL 超纯水、1 μL DNA Shuffling 专用反应液 A 混合得浓度为 0.1 U/μL 的 DNase 工作液,放冰上待用。此溶液必须现配现用。
8.在一个 PCR 管中,按顺序加入下列成分:
成分用量
同源 DNA 片段(来于多个不同基因) 2-5 μg DNA Shuffling 专用反应液 A,10× 10 μL DNA Shuffling 专用反应液 B,10× 10 μL
DNase I 工作液(0.1 U/uL) 1 μL补超纯水到100 μL
9.充分轻柔吹打混匀后 37℃保温,分别 5 分钟、6 分钟、7 分钟和 8 分钟取样
(可以根据实际情况适当调整酶切时间),每次取 25 μL 到一个新的 PCR 管中,马上放 75℃(10 min)以灭活 DNase I。
10.在 2-3%琼脂糖凝胶或 10% PAGE 胶上电泳上步所得的 4 个样品(每个 25
μL),根据 DNA 电泳 Marker 锁定的分子量范围,回收 25-150 bp 范围的
DNA 并将其溶解在超纯水中,测 260 nm 得浓度,放冰上待用。
三:无引物PCR
11.在一干净 PCR 管中加入 0.5 μg 回收片段、50 μL DNA Shuffling 专用无引物 PCR MasterMix、补加超纯水到 100 μL。反应总体积为 100 μL。按下面的PCR 反应参数进行第一轮无引物 PCR:PCR 前变性 94℃150 秒,PCR 循环 40 次(94℃ 30s,47.5℃ 45s,72℃ 10 s,每次循环后增加 5s),最后 72℃ 10 分钟。
12.PCR 结束后,取 5-10 μL PCR 产物进行电泳检测,然后对预期长度区域的 PCR 产物进行回收(如果同源区域长度为 800 bp,则回收 600-1000 bp 范围的片段)。此步将去除小片段 DNA 对下轮 PCR 的干扰。
13.预留 25%回收产物原液,剩余的 75%分三份,每份 25%。分别用超纯水将其分别稀释 10 倍、20 倍和 50 倍。
四:带引物PCR
14.分别用上步的原液、10 倍稀释液、20 倍稀释液和 50 倍稀释液各 1 μL 作为
PCR 模板,按下表设置 4 管带引物PCR 反应:
15.按下面的PCR 反应参数进行第一轮无引物 PCR:PCR 前变性 94℃150 秒, PCR 循环 25 次(94℃ 30 s,47.5℃ 45 s,72℃ 60 s,每次循环后增加5 s),最后 72℃ 10 分钟。
16.电泳检测 4 个 PCR 产物,回收预期大小的 PCR 产物(根据引物位置估计预
期大小),用于后续克隆和分析实验(略)。
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2025-06-18
2025-06-12
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