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品牌 | 烜雅生物 | 货号 | XY-D-1834 |
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规格 | 50次 | 供货周期 | 现货 |
主要用途 | 科研 | 应用领域 | 化工,生物产业 |
英文名称 | Yeast eccDNA Purification & Amplification Kit | 保存条件 | -20℃ |
有效期 | 1年 |
产品简介:
eccDNA 就是 extrachromosomal circular DNA(染色体外环状 DNA)的简称,它们是从正常基因组中分离或脱落下来,游离于染色体基因组之外的环状 DNA。长度主要分布在 0.1-5Kb 之间,99%小于 25Kb。近年来研究表明,eccDNA 普遍存在于包括酵母在内得真核细胞中,因此其进行深入研究具有重要的意义。但是纯化 eccDNA,尤其是测序级的 eccDNA 一直是个难题,为此本公司开发了本产品。
产品特点:
1.即开即用,直接用培养的酵母细胞为起始材料,最后得到纯化的 eccDNA, 用户不需要自己配制各种溶液,优化各种条件。
2.基于沉淀法,不用过柱法和磁珠法,减少短的 eccDNA 的丢失。
3.含专门的酶切消化线状 DNA 的步骤,降低线状 DNA 的干扰。
4.本产品含荧光染料法滚环扩增试剂盒,进一步富集 eccDNA。
5.本产品一次可以处理约 5×10E8 个培养的酵母细胞。
6.本产品足够 25 次 eccDNA 的纯化和扩增实验。
7.酵母 eccDNA 纯化及扩增试剂盒只能用于科研。
产品参数:
名称规格包装
酵母 eccDNA 纯化溶液 A250mL250mL 本色瓶
酵母 eccDNA 纯化溶液 B250mL250mL 本色瓶
酵母 eccDNA 纯化溶液 C250mL250mL 本色瓶
酵母 eccDNA 纯化溶液 D250mL250mL 棕色玻璃瓶
酵母 eccDNA 纯化溶液 E250mL×2250mL 本色瓶
酸洗玻璃珠(直径 800um)10g10mL 本色瓶
线状 DNA 消化缓冲液1.5mL1.5mL 绿盖管
线状 DNA 消化酶15uL0.5mL 红盖管
环状 DNA RCA 试剂盒25 次/1 套五孔盒
使用手册1 份无
运输及保存
常温运输和保存,但三个低温成分:线状 DNA 消化缓冲液、线状 DNA 消化酶
和环状 DNA RCA 试剂盒需要低温运输和-20℃保存,有效期一年。
自备试剂
75%乙醇,超纯水
使用方法:
一:eccDNA 粗提(粗体液中含有线状 DNA,线粒体 DNA 和 eccDNA)
1.培养酵母细胞:按常规方法离心沉淀 5×10E6 个酵母细胞。
2.加入 10mL 酵母 eccDNA 提取溶液 A 后重悬细胞,加入玻璃珠(800nm)0.1g,涡旋震荡 3 分钟。
3.加入 10mL 酵母 eccDNA 提取溶液 B,轻柔颠倒 10 次。
4.加入 10mL 酵母 eccDNA 提取溶液 C,轻柔颠倒 10 次。
5.常温离心 7500g 10 分钟,此步将沉淀下大部分染色体 DNA 和蛋白质。
6.将上清液体转移到新的 10mL 离心管中。
7.加入等体积的酵母 eccDNA 提取溶液 D,涡旋震荡 3 分钟。
8.常温离心 7500g 5 分钟,蛋白质将在两相中间形成白膜。小心将含 DNA 的上清转移到新的离心管中。
9.重复第 11-12 步一次。
10.常温离心 7500g 5 分钟,残留蛋白质将在两相中间形成白膜。小心将含 DNA 的上清转移到新的离心管中。
11.加入 2 倍体积的酵母 eccDNA 提取溶液 E,颠倒混匀后,常温离心 7500g 10 分钟。
12.加入自备的 10mL 75%乙醇,颠倒混匀后,常温离心 7500g 3 分钟。
13.吸弃上清后,再短暂离心,再吸弃上清。沉淀即含有酵母 eccDNA 的粗提物。
14.开盖短暂放置在室温 3 分钟。
15.加入 50uL 1×线状 DNA 消化缓冲液,再加入 1uL 线状 DNA 消化酶,轻柔吹打混匀。
16.37C 保温 2 小时。
17.加入酵母 eccDNA 提取溶液 D,充分涡旋震荡混匀。
18.常温离心 7500g 5 分钟,将上清液转移到新的离心管中。
19.加入 2 倍体积的酵母 eccDNA 提取溶液 E,颠倒混匀。
20.常温离心 4500g 10 分钟。
21.加入 10mL 75%乙醇,颠倒混匀后,常温离心 4500g 3 分钟。
22.吸弃上清,短暂离心,再吸弃上清。
23.加入 20uL 超纯水,吹打溶解酵母 eccDNA 沉淀。由于有助沉剂,所以沉淀可见。
24.取 5uL 进行 RCA 扩增,剩余的放-20℃长期保存。
25.RCA 扩增:在两个 PCR 管中,分别加入加入 5uL eccDNA 模板(样品管)
和 5uL 超纯水(阴性对照管),再分别加 10uL 2×RCA 扩增液,2uL 20×随机引物 V2.0,2uL 超纯水,共 19uL。 95℃ 5 分钟变性,立即放冰上,再分别加入 1uL 的phi39 DNA 聚合酶,30℃保温 16 小时。如果使用荧光定量 PCR仪保温,则设置每 10 分钟一个循环,温度 30℃,每次循环采集一次 SYBR 通道的荧光信号。样本管应该有标准的扩增曲线,而阴性对照管将没有扩增 曲线。
26. 70℃10 分钟变性灭活酶,所得扩增后的 DNA 可以用于各种后续实验。
选择我们的酵母 eccDNA 纯化及扩增试剂盒,就是选择精准、高效、可靠的检测方案,为您的科研实验保驾护航!