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品牌 | 烜雅生物 | 货号 | XY-D-1629 |
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规格 | 150次 | 供货周期 | 现货 |
主要用途 | 科研 | 应用领域 | 化工,生物产业 |
英文名称 | / | 保存条件 | -20℃ |
有效期 | 12个月 |
产品简介:
DNA 甲基化分析中的关键步骤是亚硫酸氢盐修饰 DNA,此反应要求 DNA 必须处于单链状态,反应还必须在低温进行。由于常规的修饰反应都在液相进行,在低温下让液相中的 DNA 保持单链状态非常棘手,故修饰效率很低。此外,修饰反应要多次切换反应液, 有多个沉淀步骤,故 DNA 回收率一般都不高于 50%。为克服这些缺点,本公司开发出了此产品。
产品特点:
1.用包埋的 DNA 进行所有操作,免去所有沉淀和纯化步骤,极大简化了操作。
2.免去了 DNA 提取过程,所需实验材料更少,最少几个细胞都可以,极大地节约了宝贵材料,尤其适用于珍-稀材料。
3.包埋中的 DNA 在整个操作过程中都处于单链状态,提高了修饰效率。
4.DNA 包埋在包埋块中,切换反应液不但非常方便,而且 DNA 回收率都在 90%以上。
5.既适用于实体材料和悬浮细胞,也适用于纯化好的 DNA 样品。
6.DNA 甲基化修饰试剂盒(凝胶法)足够制备 150 多个 10uL 包埋块(如果用纯化好的 DNA)或 25 个 10uL 包埋块(如果用悬浮细胞)。
产品参数:
产品规格
成分 | 规格 | 包装 |
DNA 甲基化修饰溶液 A | 30 mL | 30 mL 本色瓶 |
包埋液 | 1.5 mL | 2.0 mL 蓝盖、低温成分 |
包埋块裂解液 | 12.5 mL | 15 mL 低温成分 |
分子生物学级石蜡油 | 25 mL | 30 mL 本色瓶 |
蛋白酶 K 溶液(10mg/mL) | 150 uL | 2.0 mL 红盖,低温成分 |
DNA 甲基化修饰溶液B 成分一 | 2.3 g×5 | 5mL 本色瓶 |
DNA 甲基化修饰溶液B 成分二 | 110 mg×5 | 1.5mL 棕色离心管 |
TE 缓冲液,pH 8.0 | 125 mL | 125 mL 本色瓶 |
使用手册 | 1 份 | 无 |
保存和运输
常温运输及保存。蛋白酶 K 溶液(10mg/mL)、包埋液、包埋块裂解液需低温运输,
-20℃保存。有效期一年。
自备试剂
超纯水
使用方法:
一、准备试剂
1.在装有 2.3g 天净沙甲基化修饰溶液B 成分一干粉的棕色瓶中加入 3.9 mL 水和 0.9 mL 天净沙甲基化修饰溶液 A,摇晃溶解得到 4.8 mL 溶液 B 成分一。
2.在装有 110mg 溶液 B 成分二干粉的离心管中加入 1 mL 50℃预热的超纯水,摇晃溶解,得到溶液 B 成分二。
3.将 0.6 mL 溶液 B 成分二加入到 4.8 mL 溶液 B 成分一中,得到 5.4 mL 溶液 B 工作液,冰上放置待用。未用完的溶液 B 工作液不得再使用。
4.每次实验前,将装有 1.5 mL 包埋液的离心管在沸水浴上放置数分钟直到变成溶液, 然后放 80℃待用。
二、对微量组织材料(如果材料足够,可先纯化 DNA,再直接进入第三步)
5.用常规的胰-酶消化法处理动物实体组织或培养细胞,得到浓度不超过 60 个细胞/uL 的单细胞 PBS 悬液。如果实验材料已经是单细胞悬浮液(如卵细胞),则 PBS 洗涤后直接离心沉淀,再重悬在 PBS 中(浓度不超过 60 个细胞/uL)。注:本试剂盒不含本步所需相关试剂,如胰-酶消化液和 PBS。
6.在一个自备的 2 mL 离心管中加入 3 uL 上步所得细胞悬液,再迅速滴加 7 uL 在80℃预热的包埋液,共得 10uL 包埋液-细胞混合液。注:不需要吹打混匀以免混合液在抢头里面凝固。
7.加入 500 uL 分子生物学级石蜡油确保后续处理过程中溶液不会蒸发。短暂离心确保10uL 包埋液-细胞混合液沉到管底。
8.将离心管在沸冰浴中放 20 分,此步可将 DNA 分子变性成单链。
9.将离心管转移到冰上放置 30 分钟,包埋液-细胞混合液将凝固成 10uL 的包埋块, 包埋块中将包含细胞的基因组 DNA 和蛋白质组份。
10.在包埋块中加入 500 uL 包埋块裂解液和 5 uL 蛋白酶 K 溶液(10mg/mL),短暂离心后 37℃保温过夜。此步将降解包埋块中的蛋白质组份。
11.吸弃包埋块之外的所有溶液(包括石蜡油)后,分别用 1mL TE 缓冲液室温浸泡包埋块 2 次,每次 15 分钟。此步可去除残留在包埋块中的裂解液和蛋白酶 K。
12.酶切包埋块中的基因组 DNA:选定不识别 PCR 靶片段的内切酶(本试剂不提供该试剂),再用此酶对应的 100 uL 1×酶切缓冲室温液浸泡包埋块 15 分钟,吸弃该缓冲液后再加入 100 uL1×酶切缓冲和 50U 选的的内切酶,37℃保温 2 小时后吸弃内切酶反应液。
13.加入 500uL 新鲜配制的处理液 A,室温放置 15 分钟后吸弃处理液 A。处理液 A 配制方法:100 uL DNA 甲基化修饰溶液 A +400 uL 超纯水。
14.重复上步一次。此时 DNA 将呈单链。
15.加入 1 mL 新鲜配制的处理液 B(不是溶液 B),室温浸泡包埋块 5 分钟后吸弃处理液 B。处理液 B 配制方法:50uL DNA 甲基化修饰溶液 A +950 uL 超纯水。
16.加入 750uL 石蜡油,然后沸水浴 30 秒,使 DNA 变性。
17.将离心管转移到冰上放置 30 分钟使包埋块重新凝固,单链 DNA 将固化。
18.在离心管中加入 1mL 在第 3 步预冷的溶液 B 工作液,短暂离心后继续在冰上放置30 分钟。此步用于修饰固化的单链 DNA。
19.将离心管转移到 50℃放置 3.5 小时后吸弃溶液 B 工作液。
20.分别用 1mL TE 缓冲液常温洗涤包埋块 2 次,每次 15 分钟,吸弃 TE 缓冲液。
21.分别用 500 uL 新鲜配制的处理液 C(50 uL DNA 甲基化修饰溶液 A +450 uL 超纯水)常温洗涤包埋块 2 次,每次 15 分钟,然后吸弃处理液 C。
22.用 1 mL TE 缓冲液常温洗涤包埋块 3 次,每次 10 分钟,然后吸弃 TE 缓冲液。
23.所得包埋块可以在 4℃保存数月待用,也可以用超纯水洗涤两次(每次 15 分钟)后直接用做 100uL 体系甲基化 PCR 的模板。
三、对纯化好的DNA 溶液
24.如果样本是纯化好的 DNA 溶液,先用不识别 PCR 靶片段的合适内切酶酶切 DNA, 总体积不超过 20uL,DNA 不超过 700 ng。本试剂盒不提供所需内切酶。
25.酶切结束后,沸水浴 10 分钟灭活内切酶并变性 DNA。
26.冰上放置并短暂离心数秒后,再加入 4 uL DNA 甲基化修饰溶液 A,50℃保温 15 分钟。
27.迅速加入 50 uL 在 80℃预热的包埋液,用手指快速弹击管底混匀溶液并继续放 80℃ 待用。不要吹打混匀以避免包埋液在移液枪头中凝固。
28.在一个新的 2 mL 离心管中,加入1 mL 第 3 步预冷的溶液B 工作液,再加上 750 uL 石蜡油,短暂离心后将离心管放冰上预冷。
29.迅速取 80℃保温的混合液 10uL(第 27 步),用在空中滴加的方式加到第 28 步准备的预冷离心管中,滴加的混合液遇冷将迅速在石蜡油中形成一个包埋块。注意: 不要将枪头浸入到预冷的溶液中,否则包埋液将迅速在枪头内凝固。如果包埋块没 有沉到管底,可以用枪头将其拨到石蜡层下面的液相中。
30.再重复上步操作 6 次,共可以得到 7 个包埋块(每块约含 100ng DNA)。
31.将离心管(含 7 个包埋块)继续放冰上 30 分钟进行修饰。
32.后续操作同第 19-23 步。
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