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品牌 | 烜雅生物 | 货号 | XY-D-1876 |
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规格 | 100次 | 供货周期 | 现货 |
主要用途 | 科研 | 应用领域 | 化工,生物产业 |
英文名称 | SYBR Real-Time Adjustable Error-Prone PCR Kit | 保存条件 | -20℃ |
有效期 | 1年 |
产品简介:
易错PCR(Error-Prone PCR)是利用 Taq DNA 多聚酶不具有 3′→5′ 校对功能
的特性,在一定条件下(如不同的dNTP 浓度、Mg2+浓度和 MnCl2 存在)能够以较高的机率随机引入突变。如果有适当的选择方法,则可从构建的突变库中筛选出所需突变体。很多时候,用户需要通过易错PCR 得到不同突变数的DNA 片段。为满足此需求, 本公司开发了可调易错PCR 试剂盒。在实用过程中,发现易错PCR 循环数很难优化, PCR 循环数过多或过少都得不到清晰的 DNA 条带用于后续回收和克隆。本公司继续改进并推出染料法实时可调易错PCR 试剂盒。
产品特点:
1.即开即用,十分简单方便。
2.在荧光信号进入平台期即可终止循环,此时电泳就可以得到清晰的突变 DNA 条带, 不需要盲目摸索,节约大量的时间。
3.实验人员在一定范围内可以控制突变率,一轮 PCR 的突变率范围在 2-8 个突变
/1000 bp,更高的突变率可以通过多轮PCR 达到。
4.可用于连续易错 PCR,只需把上一次易错 PCR 的产物用作下一次易错 PCR 的模板即可,使每一次获得的小突变累积而产生重要的有益突变。
5.可以扩增的 DNA 片段更长,以突变率设置为 0.1%以下的条件进行扩增时,靶分子长度可达 2 Kb,对于 2 Kb 以上的产物,建议分段扩增。
6.本试剂盒足够 100 次 30 L 体系的染料法实时易错PCR。
7.染料法实时可调易错 PCR 试剂盒只能用于科研。
产品参数:
成份规格包装
5×染料法实时可调易错PCR Mix
(含dNTP)600 L1.5 mL 黄盖管
可调易错PCR 专用
Taq DNA 聚合酶(5 U/L)50 L0.5 mL 红盖管
可调易错PCR 专用 MnCl300 L0.5 mL 紫盖管
可调易错PCR 专用dGTP300 L0.5 mL 蓝盖管
10×可调易错PCR 追加dNTP300 L0.5 mL 本色管
使用手册1 份1 份
运输及保存
低温运输,-20℃保存, 有效期为一年。
自备试剂
引物、DNA 模板、常规 PCR 试剂盒。
使用方法:
1.将引物稀释到 10 μM。引物也是决定易错 PCR 成败的关键因素,设计引物时要
保证其 Tm 在 70℃,长度在 25-30 nt 之间,GC 含量在 45%-60%之间,3′ 端
GC 含量低,并且没有发夹结构。
2.用自备易错PCR 引物和自备的常规PCR 试剂扩增制备易错DNA 模板(常规 PCR 产物),胶回收并准确确定浓度。注意:易错 PCR 的模板一定要用胶回收的常规 PCR 产物,因为胶回收会可以把电泳不可见的非特异性扩增片段去除,否则这些片段由于也是用易错 PCR 引物扩增所得,在易错 PCR 扩增时也会被扩增,产生竞争抑制,降低靶分子的扩增效率。
3.将回收的 DNA 片段(模板)稀释到 100 ng/L、10 ng/L 和 1 ng/L 三个浓度。注意:模板使用量是影响突变率的最重要因素,模板 DNA 为非突变 DNA, 扩增产生的 DNA 为突变DNA,易错 PCR 体系最终 DNA 产量是基本固定的,因此模板 DNA 使用量越大,则突变 DNA 在终产物中的相对比例就越低,突变率就越低。故建议同时测试三个模板用量。如果都成功,则优先选用模板浓度低的 PCR 产物进行分析。
4.根据每 1000 bp 的预期突变数按下表确定 30 L 易错 PCR 体系中 MnCl2 和 dGTP 的用量(这是在模板 DNA 不超过 1 ng 的前提下的数据)。表中的 Mn 表示可调易错 PCR 专用的 MnCl2, dG 表示可调易错 PCR 专用的 dGTP:
5.设置 30 L 体系的可调易错PCR:第一次建议设置 3 个模板浓度。在 3 个干净的
PCR 管中,分别加入下列成分。最后加可调易错PCR 专用 MnCl2:
成分模板用量 1模板用量 2模板用量 3
5×染料法实时可调易错PCR
Mix6 L6 L6 L
可调易错PCR
专用dGTP根据上步
用量表表选择根据上步
用量表选择根据上步
用量表选择
自备 DNA 模板1 L
(100
ng/L)1 L
(10 ng/L)1 L
(1 ng/L)
自备PCR 引物(10 M each)1 L each1 L each1 L each
可调易错PCR 专用
Taq DNA 聚合酶0.5 L0.5 L0.5 L
可调易错PCR
专用 MnCl2根据上步
用量表表选择根据上步
用量表表选择根据上步
用量表表选择
自备超纯水补水到 30 L补水到 30 L补水到 30 L
注意:5×染料法实时可调易错PCR Mix 冷冻后有沉淀,使用前可 65℃水浴加热溶解至透明无色使用。
6.按已经优化的常规PCR 条件进行染料法实时易错PCR:
注:由于易错 PCR 含高浓度的 Mg2+,因此容易形成引物二聚体,因此需要使用60℃这种较高的复性温度,以避免小片段扩增产物竞争性抑制 PCR。易错 PCR 一般不需要热启动,也不需要在易错 PCR 结束后做延伸处理。易错 PCR 循环次数越多,突变 DNA(扩增产物)与非突变 DNA(原始模板)的比例就越高。此外在突变率和模板长度恒定的情况下,扩增次数越多,发生突变的绝对数就越高,在同一模板上发生的突变位点数就越多。但循环数过多或过少都不容易在电泳时形成清晰的 DNA 条带,没有条带就没法回收克隆。所以需要在荧光信号进入平台期后立即停止PCR。
7.染料法实时易错 PCR 结束后,取 3 L 电泳检查。
8.如果有预期大小的 PCR 产物,则用剩余的 PCR 产物进行胶回收,再进行克隆和测序等后续操作。
9.如需要提高突变率,可以选择上轮易错 PCR 产物为模板,再进行下一轮易错 PCR。
10.如果第一轮易错 PCR 没有得到预期大小的 PCR 产物或者扩增 60 次也没有荧光信号,可以按下列操作进行一轮追加 PCR。
11.在 PCR 管中,加入 3 L 10×可调易错PCR 专用追加dNTP 到 27 L 电泳剩下的第一轮易错PCR 体系中(用了 3 L 去电泳),按下表进行追加 PCR(chasing PCR)。注意追加 PCR 只做 20 次循环。
12.追加PCR 结束后,再电泳检测。如果有条带,再进行克隆和测序等后续操作。如果需要增加突变率,可以此轮追加PCR 的产物为模板,再进行下一轮易错 PCR。
13.如果没有预期大小的 PCR 产物,则需要分析原因。
选择我们的染料法实时可调易错 PCR 试剂盒,就是选择精准、高效、可靠的检测方案,为您的科研实验保驾护航!