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品牌 | 烜雅生物 | 货号 | XY-D-1750 |
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规格 | 100次 | 供货周期 | 现货 |
主要用途 | 科研 | 应用领域 | 化工,生物产业 |
英文名称 | Yeast Colony PCR Kit | 保存条件 | -20℃ |
有效期 | 1年 |
产品简介:
菌落 PCR 是筛选重组子的有效方法,可以使质粒鉴定过程从两天缩短到几小时。但如果宿主是酵母,其菌落 PCR 的难点则是破壁,因为酵母的细胞壁比细菌坚韧许多。本产品是基于玻璃珠破壁方法而开发的酵母菌落 PCR 产品。
产品特点:
1.破壁效率高,甚至可以用于野生型酵母。
2.既可用酵母菌落,也可用酵母培养液。
3.条件温和,菌落 PCR 可以扩增长达 3 kb 的 DNA。
4.既可小规模筛选,也适用于大规模筛查。
5.高灵敏度,既可用于扩增酵母质粒,也可以用于扩增酵母基因组 DNA。
6.PCR 反应液中含有惰性电泳染料,反应后可直接上样电泳,不需另加上样液。
7.处理过的酵母菌落样品低温长期保存后仍能用于 PCR 筛查。
8.酵母菌落PCR试剂盒足够 100 次 60 μL 体系的酵母菌落 PCR(细菌菌落 PCR 需要用另一款产品)。
产品参数:
成份 规格包装
酵母破壁液 2×1 mL1.5 mL 绿盖管
2×PCR MasterMix
(菌落筛选专用) 2×1.5 mL1.5 mL 红盖管
酸洗玻璃珠400-600 μm 3 g2.0 mL 本色管
使用手册 1 份1 份
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为一年。
自备试剂
酵母菌落,模版专一性引物,TE 缓冲液。
使用方法:
一、 酵母破壁
1.如果有 N 个样本,则标记 N+2 个 1.5 mL 的塑料离心管,N 个用于样本, 一个用于阳性对照 PC(Positive Control,确认有质粒阳性的样本),一个用于阴性对照 NC(Negative Control,可以用水代替)。
2.在每个管中加入 20 μL 酵母破壁液。
3.挑入一个新鲜酵母菌落(芝麻大小即可)或 2 μL 酵母饱和菌液。
4.加入体积跟酵母破壁液相当的酸洗玻璃珠(重量在 20-30 mg)。
5.涡旋震荡 3 分钟。
6.常温 10000 rpm 离心半分钟后可以直接取上清作为模板立即进行 PCR。如果不立即进行PCR,需将上清全部转移到新离心管中(至少可以取出 15 μL),再加入等体积的自备 TE 缓冲液,放-20℃待用。TE 缓冲液中的 EDTA 可以抑制样本中残留 DNase 的活性,可以使 DNA 的放置时间更长。
二、PCR 扩增
7. 在一个 1.5 mL 的预冷塑料离心管中分别加入下列预冷成份并充分混匀 , 得到 PCR 预混液并放冰上待用。由于有 N+2 个样本,所以配制时多加一个, 按 N+3 计算:
7.将上步得到的预冷 PCR 预混液按 59 μL/管分装到 N+2 个标记并且预冷的 PCR 管中。
8.将第 6 步制备的N+2 个样品各取 1 μL 加入上步加有 59 μL 混合液的 PCR管中。PC 样到 PC 管,NC 样到 NC 管,1 号样品加入到 1 号 PCR 管中,以此类推。由于裂解液含大量 PCR 抑制物,样本用量不要超过 1.5 μL,否则样本加得越多,PCR 越容易被抑制。
9.将 N+2 个预冷的 PCR 管快速放入 PCR 仪器中进行扩增,PCR 温度参数根据引物和模板情况由客户自己预先确定。
10.PCR 结束后直接取 10 μL 电泳直接进行琼脂糖电泳分析。本试剂盒提供的 PCR MasterMix(菌落筛选专用)中已经含有电泳示踪剂和促沉剂,故可以直接上样。橙黄色电泳染料的泳动速度对应于 50 bp 的 DNA,蓝色电泳染料的泳动速度对应于 3-5 kb 的 DNA。
11.如果阴性对照 NC 有预期大小的扩增产物,则无论阳性对照 PC 和 N 个样本的结果如何,整个实验无效。说明环境污染,需要解决污染问题再继续。 如果阳性对照 PC 没有预期大小的片段,且没有任何样本呈现阳性,则很可能是试剂、程序、引物、仪器等有问题,需要解决问题后再继续。如果有任 何一个样本呈现阳性(不包括阴性对照),则实验有效,可以继续分析每个样 品。
12.如果阳性对照有预期大小的片段,阴性对照没有,则整个实验有效。可以分析每个样品。每个样品如果有预期大小的扩增产物,则初步判断为阳性。 如果没有,则判断为阴性。
13.对阴性样本,可以用超纯水将其稀释 10 倍、百倍、千倍、万倍 4 个稀释度, 然后一起再进行 PCR 检测,如果某个稀释度的样本出现预期扩增产物,则测试时需要先将样本稀释到该稀释度后再测。
14.可以将阳性样品对应的菌落再挑出来进行培养并进行进一步的分析。
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